Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stag2O35638 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag2O35638 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stag2O35638 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms