Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Opn1mwO35599 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn1mwO35599 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms