Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pitx3O35160 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.8 ms