Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casq1O09165 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casq1O09165 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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