Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C4

Gm4340, Predicted gene 4340, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4340L7N2C4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm4340L7N2C4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm4340L7N2C4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm4340L7N2C4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm4340L7N2C4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm4340L7N2C4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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