Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm42897-201ENSMUST00000201486 2112 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm7684-201ENSMUST00000211891 829 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 9530020I12Rik-202ENSMUST00000218368 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Fgg-201ENSMUST00000048486 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Gm21887J3QQ04 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms