Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Zfp988F6VKC7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Zfp988F6VKC7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Zfp988F6VKC7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Zfp988F6VKC7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Zfp988F6VKC7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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Zfp988F6VKC7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Zfp988F6VKC7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Zfp988F6VKC7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Zfp988F6VKC7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Zfp988F6VKC7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Zfp988F6VKC7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
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Zfp988F6VKC7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Zfp988F6VKC7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Zfp988F6VKC7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Zfp988F6VKC7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Zfp988F6VKC7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Zfp988F6VKC7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Zfp988F6VKC7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Zfp988F6VKC7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Zfp988F6VKC7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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