Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf169E9Q7F2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf169E9Q7F2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms