Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20425E9Q035 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms