Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rsf1E9PWW9 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rsf1E9PWW9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms