Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Trabd2bB1ATG9 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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Trabd2bB1ATG9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trabd2bB1ATG9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Trabd2bB1ATG9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Trabd2bB1ATG9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Trabd2bB1ATG9 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Trabd2bB1ATG9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trabd2bB1ATG9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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