Protein–RNA interactions for Protein: A2VDH3

Lrrc38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc38A2VDH3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc38A2VDH3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lrrc38A2VDH3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lrrc38A2VDH3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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