Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm2A2A7B5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prdm2A2A7B5 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms