Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSB3

Gm3880, Predicted pseudogene 3880, mousemouse

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Length 72 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3880A0A1B0GSB3 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Gm3880A0A1B0GSB3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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