Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gria4Q9Z2W8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gria4Q9Z2W8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gria4Q9Z2W8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gria4Q9Z2W8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms