Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ap3b1Q9Z1T1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ap3b1Q9Z1T1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ap3b1Q9Z1T1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ap3b1Q9Z1T1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ap3b1Q9Z1T1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ap3b1Q9Z1T1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ap3b1Q9Z1T1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ap3b1Q9Z1T1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ap3b1Q9Z1T1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ap3b1Q9Z1T1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ap3b1Q9Z1T1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ap3b1Q9Z1T1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ap3b1Q9Z1T1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ap3b1Q9Z1T1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ap3b1Q9Z1T1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ap3b1Q9Z1T1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Ap3b1Q9Z1T1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ap3b1Q9Z1T1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ap3b1Q9Z1T1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ap3b1Q9Z1T1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ap3b1Q9Z1T1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Ap3b1Q9Z1T1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Ap3b1Q9Z1T1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Ap3b1Q9Z1T1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ap3b1Q9Z1T1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Ap3b1Q9Z1T1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ap3b1Q9Z1T1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Ap3b1Q9Z1T1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ap3b1Q9Z1T1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ap3b1Q9Z1T1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ap3b1Q9Z1T1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms