Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nek4Q9Z1J2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Nek4Q9Z1J2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Nek4Q9Z1J2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms