Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dctn3Q9Z0Y1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dctn3Q9Z0Y1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dctn3Q9Z0Y1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Dctn3Q9Z0Y1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dctn3Q9Z0Y1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dctn3Q9Z0Y1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dctn3Q9Z0Y1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dctn3Q9Z0Y1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Dctn3Q9Z0Y1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dctn3Q9Z0Y1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dctn3Q9Z0Y1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dctn3Q9Z0Y1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Dctn3Q9Z0Y1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dctn3Q9Z0Y1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dctn3Q9Z0Y1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Dctn3Q9Z0Y1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Dctn3Q9Z0Y1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms