Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NgfrQ9Z0W1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NgfrQ9Z0W1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NgfrQ9Z0W1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NgfrQ9Z0W1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NgfrQ9Z0W1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NgfrQ9Z0W1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NgfrQ9Z0W1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NgfrQ9Z0W1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NgfrQ9Z0W1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NgfrQ9Z0W1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NgfrQ9Z0W1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NgfrQ9Z0W1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NgfrQ9Z0W1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NgfrQ9Z0W1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NgfrQ9Z0W1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NgfrQ9Z0W1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NgfrQ9Z0W1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NgfrQ9Z0W1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NgfrQ9Z0W1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NgfrQ9Z0W1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms