Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnip1Q9WUU8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tnip1Q9WUU8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Tnip1Q9WUU8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnip1Q9WUU8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms