Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Opn3Q9WUK7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Opn3Q9WUK7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Opn3Q9WUK7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms