Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mixl1Q9WUI0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mixl1Q9WUI0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms