Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim10Q9WUH5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim10Q9WUH5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim10Q9WUH5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms