Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TapbpQ9R233 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TapbpQ9R233 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TapbpQ9R233 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms