Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W3

Rnf103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf103Q9R1W3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf103Q9R1W3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rnf103Q9R1W3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rnf103Q9R1W3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf103Q9R1W3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf103Q9R1W3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf103Q9R1W3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf103Q9R1W3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf103Q9R1W3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf103Q9R1W3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf103Q9R1W3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf103Q9R1W3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf103Q9R1W3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf103Q9R1W3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf103Q9R1W3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf103Q9R1W3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms