Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc26a4Q9R155 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc26a4Q9R155 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc26a4Q9R155 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms