Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pcm1Q9R0L6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcm1Q9R0L6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcm1Q9R0L6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms