Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek3Q9R0A5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek3Q9R0A5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nek3Q9R0A5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nek3Q9R0A5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms