Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nphs1Q9QZS7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nphs1Q9QZS7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms