Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf4Q9QZS2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf4Q9QZS2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf4Q9QZS2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms