Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Copg1Q9QZE5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Copg1Q9QZE5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms