Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn8Q9QZ49 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ubxn8Q9QZ49 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn8Q9QZ49 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms