Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Six6Q9QZ28 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Six6Q9QZ28 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Six6Q9QZ28 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms