Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nphp1Q9QY53 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nphp1Q9QY53 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nphp1Q9QY53 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nphp1Q9QY53 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms