Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx8Q9QXV1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cbx8Q9QXV1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx8Q9QXV1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms