Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kcnip3Q9QXT8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcnip3Q9QXT8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms