Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Trip4Q9QXN3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trip4Q9QXN3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trip4Q9QXN3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms