Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trp53inp1Q9QXE4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trp53inp1Q9QXE4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trp53inp1Q9QXE4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trp53inp1Q9QXE4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms