Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca3a1Q9QX15 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clca3a1Q9QX15 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca3a1Q9QX15 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms