Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tcea2Q9QVN7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tcea2Q9QVN7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tcea2Q9QVN7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms