Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cln8Q9QUK3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cln8Q9QUK3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cln8Q9QUK3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms