Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rfx5Q9JL61 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfx5Q9JL61 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfx5Q9JL61 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfx5Q9JL61 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms