Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Arl6ip1Q9JKW0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arl6ip1Q9JKW0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms