Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ldb3Q9JKS4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ldb3Q9JKS4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ldb3Q9JKS4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.4 ms