Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mrpl39Q9JKF7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mrpl39Q9JKF7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mrpl39Q9JKF7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms