Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gfra4Q9JJT2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gfra4Q9JJT2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gfra4Q9JJT2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gfra4Q9JJT2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms