Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ascl3Q9JJR7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ascl3Q9JJR7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ascl3Q9JJR7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms