Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA2

Cog8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog8Q9JJA2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cog8Q9JJA2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cog8Q9JJA2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cog8Q9JJA2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms