Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Sv2aQ9JIS5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sv2aQ9JIS5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sv2aQ9JIS5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2aQ9JIS5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2aQ9JIS5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2aQ9JIS5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2aQ9JIS5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sv2aQ9JIS5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sv2aQ9JIS5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sv2aQ9JIS5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sv2aQ9JIS5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sv2aQ9JIS5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sv2aQ9JIS5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sv2aQ9JIS5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sv2aQ9JIS5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sv2aQ9JIS5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sv2aQ9JIS5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sv2aQ9JIS5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sv2aQ9JIS5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms