Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIE3

Otor, Otoraplin, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtorQ9JIE3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtorQ9JIE3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OtorQ9JIE3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OtorQ9JIE3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms